More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1658 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 498 aa  977    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  51.11 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.28 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 467 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  47.07 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  46.4 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.25 
 
 		 476 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  41.97 
 
 		 457 aa  313  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.27 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.4 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  40.62 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.87 
 
 		 471 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  41.41 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.71 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.09 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.77 
 
 		 479 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.47 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.8 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.4 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.09 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.36 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.5 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 484 aa  226  9e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 444 aa  226  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.26 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.26 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.11 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.07 
 
 		 475 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 471 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.97 
 
 		 467 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  36 
 
 		 537 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 492 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.94 
 
 		 485 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  36.46 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.36 
 
 		 496 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  29.42 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.17 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.16 
 
 		 485 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 466 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 466 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.01 
 
 		 464 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  31.44 
 
 		 481 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.02 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 473 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 466 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 466 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 466 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.81 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 502 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 502 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 502 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  29.58 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 466 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.8 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 490 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 511 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>