More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6107 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 479 aa  955    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.58 
 
 		 478 aa  329  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.72 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.89 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.17 
 
 		 474 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 		 476 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.72 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  37.77 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  38.8 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.39 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.5 
 
 		 471 aa  240  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.64 
 
 		 470 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.78 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 474 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.82 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.11 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 480 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.29 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  28.05 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.8 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 493 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4809  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 		 508 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.367164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.85 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 477 aa  201  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 507 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.97 
 
 		 464 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 496 aa  196  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 		 491 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 478 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.83 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 537 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.94 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.99 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 504 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.59 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  33.26 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  34.54 
 
 		 515 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 569 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.61 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 466 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.79 
 
 		 465 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.06 
 
 		 497 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 493 aa  189  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.36 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 515 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.32 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.71 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.21 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1430  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.149047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.14 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.48 
 
 		 485 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 494 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.83 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.51 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 485 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  26.68 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 493 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 495 aa  183  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  30.02 
 
 		 501 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2017  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.70352  normal  0.217844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>