More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1082 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 457 aa  884    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  52.93 
 
 		 481 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.63 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  48.48 
 
 		 470 aa  332  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  42.6 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.95 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.85 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.62 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.89 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.57 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  44.47 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  42.82 
 
 		 467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  46.07 
 
 		 473 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 474 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.11 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.04 
 
 		 492 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.42 
 
 		 486 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.52 
 
 		 479 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.55 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.63 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.8 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4809  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.58 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.367164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.96 
 
 		 464 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.33 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 502 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 520 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.94 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  35.73 
 
 		 516 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.94 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 494 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 494 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.91 
 
 		 476 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 493 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.58 
 
 		 507 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 494 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 494 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 490 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 497 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.09 
 
 		 485 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 494 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.29 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.05 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.07 
 
 		 495 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 503 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.76 
 
 		 499 aa  222  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.05 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 509 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.63 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.72 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.8 
 
 		 465 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 504 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 470 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>