More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1257 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 494 aa  949    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  54.96 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.39 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09150  transcriptional regulator, GntR family  47.51 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5991  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.57 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0648  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.7 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4541  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.6 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6988  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 504 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 494 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 475 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 480 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 494 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.09 
 
 		 485 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.88 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 488 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 490 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.22 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 485 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 574 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 478 aa  246  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.36 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.24 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 476 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 502 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.82 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.84 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.08 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 509 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  35 
 
 		 501 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 497 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.23 
 
 		 497 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.93 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.85 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 516 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 490 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  33.6 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.28 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3468  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00974022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 506 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 506 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 506 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 506 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 506 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 467 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  38.5 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  39.44 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 477 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 501 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 569 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  39.22 
 
 		 493 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 506 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.21 
 
 		 507 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 502 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 507 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.09 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  36.74 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.97 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 499 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.9 
 
 		 501 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>