More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2490 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
471 aa  889    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.34 
 
 
481 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  47.92 
 
 
457 aa  346  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.19 
 
 
474 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  48.89 
 
 
473 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.12 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  46.03 
 
 
481 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.89 
 
 
467 aa  316  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  45.93 
 
 
466 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  47.54 
 
 
470 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 
470 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.57 
 
 
479 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.57 
 
 
476 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  44.14 
 
 
498 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
485 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  44.69 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4809  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.55 
 
 
508 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.367164  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.18 
 
 
503 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.83 
 
 
492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  41.85 
 
 
477 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.54 
 
 
470 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 
463 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
493 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  40.86 
 
 
510 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.28 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  37.03 
 
 
508 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
474 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
490 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  39.15 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
488 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.4 
 
 
464 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
467 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.25 
 
 
485 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.55 
 
 
485 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
452 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
452 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.8 
 
 
491 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
452 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.46 
 
 
494 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.16 
 
 
509 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
473 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  42.37 
 
 
502 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
466 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
466 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.14 
 
 
529 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  42.14 
 
 
515 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  33.11 
 
 
466 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  35.38 
 
 
504 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.28 
 
 
507 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  41.78 
 
 
490 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
490 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
502 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
502 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.38 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  41.93 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  31.18 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.94 
 
 
478 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
569 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
477 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
466 aa  253  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.44 
 
 
501 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
494 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  38.75 
 
 
509 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
466 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 
466 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
515 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
466 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.55 
 
 
504 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  34.14 
 
 
481 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  38.12 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
466 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 
466 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.8 
 
 
516 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
494 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
524 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
492 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.55 
 
 
502 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
502 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
502 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
473 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  40.96 
 
 
501 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
501 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.1 
 
 
488 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.47 
 
 
444 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.95 
 
 
488 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.47 
 
 
444 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
444 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
444 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
444 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
507 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
466 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
494 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>