More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5086 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 452 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 452 aa  873    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 452 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 467 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  72.47 
 
 		 474 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.38 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  54.69 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  46.94 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  48.11 
 
 		 473 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.87 
 
 		 476 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.75 
 
 		 492 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.79 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  43.82 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.06 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.44 
 
 		 503 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.91 
 
 		 474 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.15 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.78 
 
 		 471 aa  250  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.23 
 
 		 529 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.04 
 
 		 478 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.43 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  30.79 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 503 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.42 
 
 		 467 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 466 aa  223  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 466 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.41 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  34.99 
 
 		 444 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.68 
 
 		 499 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 466 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 523 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.9 
 
 		 501 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.39 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.93 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.96 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.75 
 
 		 444 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.11 
 
 		 494 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.75 
 
 		 444 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 463 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 513 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.21 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 492 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 496 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 496 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.15 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  33.19 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 569 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 496 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.99 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 475 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>