More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5625 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  79.49 
 
 		 474 aa  708    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 467 aa  919    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  74.33 
 
 		 452 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.51 
 
 		 470 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  53.38 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  46.64 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.28 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  46.95 
 
 		 473 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.17 
 
 		 492 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.03 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  42.04 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.24 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.98 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.02 
 
 		 479 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.39 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.24 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.08 
 
 		 465 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 509 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 444 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 501 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 503 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.46 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 501 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.16 
 
 		 529 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.43 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  39.26 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 506 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  34.61 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.16 
 
 		 467 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 569 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.68 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.68 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 444 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 523 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 537 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.2 
 
 		 515 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.97 
 
 		 499 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.98 
 
 		 471 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 511 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 503 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 502 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  34.79 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  33.57 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 507 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  32.36 
 
 		 504 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.97 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.77 
 
 		 489 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.33 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  32.36 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.47 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.62 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.12 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.26 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 521 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.35 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 507 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.62 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.89 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6494  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.04 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.36 
 
 		 474 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  31.72 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>