More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1181 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
474 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  79.49 
 
 
467 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  72.47 
 
 
452 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  72.47 
 
 
452 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  72.47 
 
 
452 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.78 
 
 
470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  55.24 
 
 
466 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  46.49 
 
 
498 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.25 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  46.47 
 
 
473 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.67 
 
 
492 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  42.11 
 
 
457 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.68 
 
 
503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  41.75 
 
 
481 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.5 
 
 
481 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.34 
 
 
474 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.99 
 
 
470 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
496 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.49 
 
 
471 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
492 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
492 aa  240  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36 
 
 
479 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.29 
 
 
465 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
444 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.87 
 
 
444 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.87 
 
 
444 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
444 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  39.31 
 
 
470 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
509 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.02 
 
 
470 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.86 
 
 
478 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.96 
 
 
489 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
444 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
509 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
506 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
506 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
506 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
506 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 
463 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
503 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.9 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
506 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
490 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.54 
 
 
501 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.19 
 
 
471 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.3 
 
 
515 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  33.87 
 
 
509 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
501 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 
466 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  31.94 
 
 
466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.83 
 
 
499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
466 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
466 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.03 
 
 
495 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
517 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  32.64 
 
 
504 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  34.26 
 
 
488 aa  222  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 
466 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
569 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  35.24 
 
 
537 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.53 
 
 
494 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
466 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  31.8 
 
 
523 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
491 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  34.48 
 
 
508 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  32.1 
 
 
521 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  33.97 
 
 
503 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
466 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
513 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.27 
 
 
464 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
473 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  33.26 
 
 
499 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
507 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.01 
 
 
476 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  30.19 
 
 
463 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.33 
 
 
507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
466 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.76 
 
 
499 aa  216  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
507 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35 
 
 
509 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.91 
 
 
495 aa  216  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
466 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  32.3 
 
 
511 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
471 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>