More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2630 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  98.6 
 
 		 430 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  98.6 
 
 		 430 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  98.84 
 
 		 430 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 430 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  97.67 
 
 		 430 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  51.28 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.42 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  43.48 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  41.34 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.93 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.71 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.65 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.25 
 
 		 462 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.94 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.61 
 
 		 442 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.31 
 
 		 462 aa  176  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  31.26 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.36 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.93 
 
 		 441 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.47 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.23 
 
 		 497 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  28.94 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  28.74 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 480 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.95 
 
 		 477 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.53 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 477 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 477 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 480 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 495 aa  99.8  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.63 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  25.53 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 460 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.76 
 
 		 488 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.54 
 
 		 477 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.57 
 
 		 482 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  27.77 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 481 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.54 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.12 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.19 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 457 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 498 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.57 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 501 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 547 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 480 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 501 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 467 aa  93.2  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.04 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.92 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  25.25 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  25.97 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  28.47 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.47 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.41 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  28.47 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.73 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.96 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 460 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  27.02 
 
 		 477 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.5 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 503 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>