More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000881 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  79.45 
 
 		 478 aa  798    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  100 
 
 		 478 aa  993    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.98 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.15 
 
 		 492 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  34.74 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.74 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  35.35 
 
 		 471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 470 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.65 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 480 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.12 
 
 		 479 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 477 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  35.02 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.13 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  33.47 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.91 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 504 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 496 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  34.04 
 
 		 473 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 496 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  36.34 
 
 		 474 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.47 
 
 		 477 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 474 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 473 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.31 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 483 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 472 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 473 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  32.49 
 
 		 493 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 532 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  32 
 
 		 473 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.38 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.08 
 
 		 475 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.83 
 
 		 486 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.29 
 
 		 471 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 477 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.59 
 
 		 487 aa  237  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  31.8 
 
 		 471 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 470 aa  236  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.28 
 
 		 472 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 487 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  31.87 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 474 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 474 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 474 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 475 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 474 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>