More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000386 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  100 
 
 		 471 aa  979    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  53.16 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.94 
 
 		 483 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.25 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  54.47 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.47 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  54.47 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  54.47 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.93 
 
 		 473 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 470 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.63 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  54.68 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  52.99 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  52.98 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  52.98 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  53.09 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  52.98 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  53.09 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  50 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  49.18 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  47.53 
 
 		 473 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  44.85 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  43.93 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 487 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  43.25 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 477 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  44.02 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  43.83 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.9 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  41.94 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 473 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 483 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  43.25 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 489 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.51 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.74 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 481 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  40.64 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.48 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 532 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  40.18 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  39.06 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  40 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  38.76 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>