More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4186 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  843    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.03 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 430 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.39 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  43.68 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  37.96 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.57 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.05 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.93 
 
 		 452 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.95 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.44 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.79 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.67 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.22 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.64 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.56 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  25.57 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  22.2 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.54 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.62 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.33 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  28.7 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  24.72 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.64 
 
 		 517 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.84 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  23.11 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.11 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.78 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  23.11 
 
 		 480 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5610  putative transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.62 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 491 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.77 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.49 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  24.12 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.44 
 
 		 498 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.22 
 
 		 468 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  23.2 
 
 		 477 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 477 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.88 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.14 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.99 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 470 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3154  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.08 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  27.64 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 467 aa  94.4  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 477 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 477 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 520 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 481 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 479 aa  93.6  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.51 
 
 		 468 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 462 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 514 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>