More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1430 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 446 aa  844    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  54.93 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.05 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  42.08 
 
 		 532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.41 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 430 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.91 
 
 		 462 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  39.95 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 430 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 430 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.77 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.33 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  34.64 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.28 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.78 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.7 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.7 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 477 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  31.7 
 
 		 498 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.43 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1062  MocR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.92 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.91 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  33.25 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.51 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  25.06 
 
 		 470 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.67 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.18 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.12 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.12 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.18 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.18 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.89 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.18 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  30.18 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  28.45 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  26.17 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  28.54 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.03 
 
 		 488 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 477 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 477 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  27.1 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 477 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  27.87 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 468 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.27 
 
 		 517 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 504 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.83 
 
 		 468 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 480 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 468 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 468 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  28.83 
 
 		 468 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>