More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3968 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  70.04 
 
 
463 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  68.75 
 
 
463 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  91.81 
 
 
461 aa  851    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  100 
 
 
464 aa  935    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5020  transcriptional regulator, GntR family  94.9 
 
 
199 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.640165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.51 
 
 
479 aa  253  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.62 
 
 
481 aa  249  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
474 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
476 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 
467 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
478 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
473 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  32.9 
 
 
467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
457 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
478 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  39.2 
 
 
460 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.19 
 
 
467 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
464 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.48 
 
 
474 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.41 
 
 
444 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
465 aa  226  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  34.53 
 
 
444 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  34.28 
 
 
479 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
462 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
460 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  32.68 
 
 
462 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
444 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.5 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.8 
 
 
465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  33.87 
 
 
444 aa  216  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
460 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  33.71 
 
 
446 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
472 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
470 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  30.8 
 
 
477 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
470 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  34.45 
 
 
447 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
478 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
514 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.87 
 
 
461 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  31.38 
 
 
470 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  31.78 
 
 
460 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  33.18 
 
 
470 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
456 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
447 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
447 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.26 
 
 
471 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.11 
 
 
467 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  32.29 
 
 
465 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  34.35 
 
 
463 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  32.74 
 
 
470 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
470 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
470 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  33.26 
 
 
470 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
470 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  32.39 
 
 
463 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.8 
 
 
461 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
465 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.24 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  30.99 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.18 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
456 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  32.58 
 
 
442 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  32.49 
 
 
480 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  34.9 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
465 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.37 
 
 
463 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
463 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.31 
 
 
469 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
456 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
466 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.64 
 
 
471 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  32.68 
 
 
453 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
465 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
486 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
462 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  31.71 
 
 
468 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
466 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  31.53 
 
 
489 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
452 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
447 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 
463 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.62 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  29.68 
 
 
452 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
469 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3760  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
446 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
454 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
443 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
468 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>