More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4117 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  100 
 
 		 431 aa  875    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.77 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  46.21 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  37.96 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.68 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  33.41 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.49 
 
 		 446 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  34.1 
 
 		 532 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 442 aa  179  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.29 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.18 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.59 
 
 		 462 aa  169  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.82 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.32 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.64 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02394  putative transcription regulator protein  28.92 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.41 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.340395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4272  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.41 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200991  normal  0.884881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  27.07 
 
 		 444 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 496 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  27.58 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 479 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.74 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.74 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 520 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  22.72 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 478 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.54 
 
 		 493 aa  93.2  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  27.9 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  27.42 
 
 		 473 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 340 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 483 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 476 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 473 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.27 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.12 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.684396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.49 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.38 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.12 
 
 		 517 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 469 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.71 
 
 		 483 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.9 
 
 		 497 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 470 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0247  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 482 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 470 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.08 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  22.29 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  29.18 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.63 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3668  transcriptional regulator  28.6 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22591  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  28.72 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.52 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  22.08 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  22.14 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4014  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920353  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  21.97 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.51 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  21.87 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4240  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.4 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>