More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2563 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  100 
 
 
434 aa  864    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
442 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.98 
 
 
442 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
442 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
432 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  37.24 
 
 
436 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  37.3 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
430 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  37.06 
 
 
430 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
430 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.01 
 
 
455 aa  202  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.14 
 
 
446 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.3 
 
 
444 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  33.41 
 
 
431 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.63 
 
 
448 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.88 
 
 
462 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32 
 
 
441 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.24 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.24 
 
 
441 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.02 
 
 
462 aa  133  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
532 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.54 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  27.29 
 
 
445 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
458 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.22 
 
 
461 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  30.21 
 
 
457 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.89 
 
 
481 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
485 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
480 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
463 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.59 
 
 
483 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  25.38 
 
 
480 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
480 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
480 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.99 
 
 
461 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  25.65 
 
 
480 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
480 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  28.66 
 
 
484 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.16 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  24.95 
 
 
480 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.95 
 
 
480 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  30.3 
 
 
476 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0087  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
525 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
480 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.3 
 
 
477 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.11 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  27.01 
 
 
502 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.06 
 
 
477 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.06 
 
 
477 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  25 
 
 
446 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.45 
 
 
477 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.06 
 
 
477 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.12 
 
 
477 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
470 aa  93.2  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.59 
 
 
477 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  26.87 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.21 
 
 
473 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.12 
 
 
477 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.44 
 
 
498 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  27.62 
 
 
498 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.46 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.85 
 
 
462 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
480 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.46 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
444 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
502 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
502 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
444 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  29.35 
 
 
586 aa  90.1  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
444 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
466 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
466 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.24 
 
 
474 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  24.19 
 
 
480 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24.51 
 
 
480 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
444 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.54 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.54 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.54 
 
 
474 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  30.54 
 
 
474 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
478 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  27.66 
 
 
478 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.95 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
493 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
481 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
492 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
470 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
477 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.17 
 
 
472 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  22.1 
 
 
466 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
504 aa  86.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>