More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5234 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  94.36 
 
 		 461 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  81.13 
 
 		 478 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 461 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 461 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  59.78 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 460 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 464 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  34.9 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 465 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 470 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 470 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.55 
 
 		 467 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.6 
 
 		 469 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.93 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.21 
 
 		 481 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.26 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  31.68 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 514 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.52 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.87 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.89 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.31 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.24 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.26 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 478 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  29.4 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.82 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.3 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.13 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.92 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.62 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.09 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  31.7 
 
 		 463 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  32.73 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.42 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.83 
 
 		 472 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.04 
 
 		 472 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1929  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0480114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  29.66 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1931  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.47 
 
 		 463 aa  163  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5878  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 455 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3760  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 462 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  25.74 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  28.63 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>