More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1967 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  76.8 
 
 
444 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  93.24 
 
 
478 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  93.24 
 
 
473 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  100 
 
 
444 aa  875    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  74.1 
 
 
444 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  93.24 
 
 
478 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  74.77 
 
 
444 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  70.59 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  65.99 
 
 
444 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  61.28 
 
 
442 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  52.7 
 
 
446 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
443 aa  356  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  36.19 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.44 
 
 
447 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.81 
 
 
463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
464 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
447 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  37.61 
 
 
463 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 
479 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  35.25 
 
 
447 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.87 
 
 
464 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
447 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
447 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.33 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
456 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.12 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  35.17 
 
 
463 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
470 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
470 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
467 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.1 
 
 
467 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  35.46 
 
 
470 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.5 
 
 
469 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
469 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  34.29 
 
 
480 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  32.27 
 
 
467 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  35.38 
 
 
479 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1929  transcriptional regulator  39.59 
 
 
444 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0480114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.41 
 
 
467 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  30.54 
 
 
465 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.51 
 
 
461 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
462 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.24 
 
 
467 aa  206  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 
461 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.71 
 
 
474 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  32.15 
 
 
470 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
481 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.28 
 
 
463 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
470 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.73 
 
 
461 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
465 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
478 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
465 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
456 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.27 
 
 
465 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  31.04 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  33.11 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  30.4 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
470 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
470 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
474 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  31.57 
 
 
460 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
460 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
464 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
465 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
467 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  28.81 
 
 
477 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.17 
 
 
493 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  33.96 
 
 
460 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
462 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.43 
 
 
471 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  33.49 
 
 
453 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.23 
 
 
471 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.26 
 
 
463 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  32.51 
 
 
468 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
457 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  37.44 
 
 
460 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
461 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
453 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  33.26 
 
 
463 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1931  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
466 aa  176  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
448 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
448 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3760  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  33.33 
 
 
489 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  31.98 
 
 
461 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  33.41 
 
 
470 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
465 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  27.17 
 
 
446 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5878  transcriptional regulator  32.87 
 
 
455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.11 
 
 
464 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
466 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
456 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>