More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1400 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 464 aa  925    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5878  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 455 aa  329  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3760  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.39 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.97 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 462 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34 
 
 		 479 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 489 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  36.64 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  31.7 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.34 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 514 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.4 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.26 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  32.67 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 444 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.43 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.8 
 
 		 463 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.34 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.42 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.41 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.14 
 
 		 504 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  32.51 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 465 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 447 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.88 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  34.61 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 462 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.97 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.41 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2527  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0148253  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.61 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  29.34 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 476 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 460 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.19 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.67 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>