More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0907 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  79.23 
 
 		 467 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 467 aa  941    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  91.65 
 
 		 467 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  65.74 
 
 		 461 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.8 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.23 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  54.53 
 
 		 479 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.02 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.36 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  45.43 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.26 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.64 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.96 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 460 aa  280  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  38.63 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 465 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  37.64 
 
 		 470 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 474 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 453 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.98 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  36.38 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  34.61 
 
 		 468 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  38.88 
 
 		 456 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.36 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.07 
 
 		 444 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 462 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.22 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.62 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.62 
 
 		 504 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.19 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 464 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.98 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.75 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.26 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 467 aa  222  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.48 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  33.62 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 463 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  33.87 
 
 		 444 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  31.45 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 467 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 467 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  28.85 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.95 
 
 		 472 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>