More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6780 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 469 aa  932    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.48 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  53.71 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  53.48 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  53.48 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1929  transcriptional regulator  50.6 
 
 		 444 aa  349  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0480114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  36.01 
 
 		 444 aa  216  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 470 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 470 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.04 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.43 
 
 		 481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.64 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  34.11 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.88 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.72 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.04 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.86 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 456 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.03 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.93 
 
 		 461 aa  186  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.49 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.13 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.54 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.18 
 
 		 463 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  31.81 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  31.25 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.18 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 470 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  28.41 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.96 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 467 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  28.6 
 
 		 477 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.51 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 465 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.35 
 
 		 474 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  30.87 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.12 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5878  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 455 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  28.47 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.64 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 465 aa  150  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.16 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>