More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2486 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  84.96 
 
 		 452 aa  811    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 452 aa  913    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  98.23 
 
 		 452 aa  914    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  98.67 
 
 		 452 aa  918    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  85.4 
 
 		 452 aa  819    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  85.18 
 
 		 452 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  86.56 
 
 		 454 aa  818    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  86.06 
 
 		 460 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  100 
 
 		 452 aa  929    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  61.54 
 
 		 454 aa  588  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2527  transcriptional regulator  55.92 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2016  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.05 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.28 
 
 		 479 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.68 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.97 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  27.89 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.53 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.16 
 
 		 481 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 514 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.68 
 
 		 467 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.42 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.66 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.79 
 
 		 467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.37 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 470 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.27 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.69 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  27.29 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.57 
 
 		 444 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.62 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  30.11 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.02 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 456 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.02 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 498 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.8 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1931  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.41 
 
 		 472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 478 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>