More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2266 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  91.37 
 
 		 452 aa  861    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  86.5 
 
 		 452 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  86.28 
 
 		 452 aa  824    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  84.8 
 
 		 454 aa  804    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  95.8 
 
 		 452 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  95.35 
 
 		 452 aa  896    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  86.28 
 
 		 452 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 460 aa  947    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  86.06 
 
 		 452 aa  823    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  60.66 
 
 		 454 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2527  transcriptional regulator  55.04 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2016  GntR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.19 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.39 
 
 		 467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  28.09 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.77 
 
 		 479 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.17 
 
 		 481 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.48 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 514 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 476 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.8 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 465 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 470 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.21 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.39 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.27 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.79 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.16 
 
 		 464 aa  159  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 460 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 470 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 498 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 474 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.87 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  31.19 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.35 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.19 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.81 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  27.09 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.07 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.67 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 478 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1931  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.35 
 
 		 469 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.47 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  28.51 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  27.08 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 465 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 444 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 480 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>