More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4502 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  100 
 
 		 460 aa  915    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  55.83 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  51.46 
 
 		 489 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.71 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.4 
 
 		 471 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.88 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  44.42 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  41.52 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.27 
 
 		 463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 		 514 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.68 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 463 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 		 471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.5 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  44.42 
 
 		 456 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.83 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.82 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.26 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  38.62 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  37.39 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.73 
 
 		 465 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.43 
 
 		 463 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 474 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 462 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 476 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.79 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  34.54 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.04 
 
 		 463 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 470 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 470 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.78 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.73 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.69 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 470 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 470 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.87 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 460 aa  209  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  31.26 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.19 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.4 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.19 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 465 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 447 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 467 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 467 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  28.1 
 
 		 477 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 452 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.72 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 452 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  29.44 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  30.67 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>