More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1990 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 461 aa  920    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.24 
 
 		 467 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  65.1 
 
 		 467 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  66.81 
 
 		 467 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.33 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.35 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  54.21 
 
 		 479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.8 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 463 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.17 
 
 		 463 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  42.76 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  44.2 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.92 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.89 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  40.35 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 470 aa  269  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 480 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.71 
 
 		 504 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 462 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.77 
 
 		 471 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 470 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.68 
 
 		 469 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 470 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 470 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.61 
 
 		 461 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 470 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 470 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 447 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.95 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 460 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.96 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 470 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.89 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  31.24 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.89 
 
 		 461 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 461 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 473 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.37 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.28 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.9 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  34.79 
 
 		 460 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  28.97 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 472 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  32.17 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.91 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  33.79 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  31.47 
 
 		 474 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 460 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>