More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3799 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 504 aa  996    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  44.95 
 
 		 489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  47.76 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 460 aa  348  9e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.5 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.8 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.91 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.86 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 456 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.06 
 
 		 479 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 514 aa  256  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.49 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.21 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.62 
 
 		 467 aa  240  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.57 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.96 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36 
 
 		 463 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  35.18 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 474 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 463 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.24 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.63 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.11 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 462 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.79 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.41 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.14 
 
 		 464 aa  179  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 468 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 470 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 463 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 470 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 448 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 448 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  29.02 
 
 		 477 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 470 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 461 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  30.7 
 
 		 461 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.45 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.85 
 
 		 472 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 460 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  26.54 
 
 		 474 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.48 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1929  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0480114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.34 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.24 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.57 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>