More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2141 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
472 aa  960    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  92.58 
 
 
472 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  65.03 
 
 
472 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  60.04 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  55.39 
 
 
474 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
476 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  33.12 
 
 
470 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
474 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
460 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
470 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
470 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  33.19 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
462 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
467 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
471 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
514 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.69 
 
 
461 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
467 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
467 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  32.32 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.53 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
486 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.57 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.83 
 
 
471 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.75 
 
 
467 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.34 
 
 
469 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.1 
 
 
461 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.06 
 
 
474 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.82 
 
 
481 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  30.72 
 
 
467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  31.01 
 
 
463 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
461 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
465 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  29.59 
 
 
465 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.8 
 
 
467 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.48 
 
 
447 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  32.15 
 
 
470 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.04 
 
 
461 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
463 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  30.87 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
465 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  29.96 
 
 
463 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
467 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
467 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.28 
 
 
463 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  28.11 
 
 
470 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
464 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  29.22 
 
 
470 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
470 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
465 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
470 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
470 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  28.08 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
466 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  29.57 
 
 
463 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  29.22 
 
 
447 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  31.55 
 
 
460 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  29.83 
 
 
468 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  29.34 
 
 
479 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  27.1 
 
 
477 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.54 
 
 
463 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
466 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.54 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.29 
 
 
471 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  29.61 
 
 
453 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
478 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  28.9 
 
 
444 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
447 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  30.39 
 
 
461 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.94 
 
 
463 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
472 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
452 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
443 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
464 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 
446 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
444 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
452 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
463 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  26.83 
 
 
454 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
457 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.88 
 
 
464 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  30.37 
 
 
463 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.87 
 
 
452 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
454 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
452 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.57 
 
 
504 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  29.38 
 
 
442 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  28.41 
 
 
452 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
456 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
478 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
452 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1931  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  29.73 
 
 
444 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
460 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.99423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>