More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1974 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 514 aa  1016    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.7 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  57.8 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.87 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.13 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.02 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  47.98 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.52 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.96 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  46.98 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.28 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 463 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 463 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.19 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 462 aa  346  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 456 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.49 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.11 
 
 		 463 aa  339  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  42 
 
 		 460 aa  320  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  42.32 
 
 		 470 aa  313  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 460 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  42.46 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5794  GntR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 465 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0227709  normal  0.15383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  36.58 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.69 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 470 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 470 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 474 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 470 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5823  transcriptional regulator  40.09 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.9305  normal  0.224047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 462 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 467 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 456 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.04 
 
 		 504 aa  258  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 470 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 465 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 470 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 470 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.54 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  32.25 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.18 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  33.19 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 468 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 486 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.23 
 
 		 474 aa  220  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.83 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  34.06 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.71 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 473 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.05 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.14 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.22 
 
 		 447 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  31.6 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.64 
 
 		 472 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 472 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 478 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.8 
 
 		 472 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 446 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  35.55 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3760  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>