More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2134 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
454 aa  937    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  82.6 
 
 
452 aa  791    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  86.78 
 
 
452 aa  820    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  86.34 
 
 
452 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  84.14 
 
 
452 aa  802    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  83.7 
 
 
452 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  86.56 
 
 
452 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  86.78 
 
 
452 aa  818    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  84.8 
 
 
460 aa  804    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  61.49 
 
 
454 aa  591  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2527  transcriptional regulator  55.46 
 
 
455 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2016  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 
447 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
486 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  28.23 
 
 
463 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.12 
 
 
461 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.24 
 
 
464 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.53 
 
 
463 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.1 
 
 
479 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.51 
 
 
481 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
514 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.21 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  28.09 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.85 
 
 
461 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  30.79 
 
 
460 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.74 
 
 
467 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
462 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.93 
 
 
474 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
467 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
467 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  28.17 
 
 
462 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.58 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  27.8 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  31.9 
 
 
463 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 
474 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
477 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
460 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  27.06 
 
 
470 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 
465 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
470 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  27.8 
 
 
470 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
470 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  29.84 
 
 
463 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
464 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
470 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  28.6 
 
 
442 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  26.37 
 
 
479 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
461 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.64 
 
 
471 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
467 aa  156  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.01 
 
 
444 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
465 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.3 
 
 
464 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.69 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
456 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
463 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
472 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
463 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 
446 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.94 
 
 
472 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
457 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4580  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
456 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  27.88 
 
 
474 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  27.33 
 
 
465 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  28.44 
 
 
444 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  27.07 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
456 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
467 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.98 
 
 
498 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.64 
 
 
467 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
453 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  27.34 
 
 
470 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  28.06 
 
 
468 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
481 aa  142  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2141  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.55 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196836  normal  0.113478 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.96 
 
 
469 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  26.34 
 
 
480 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  28.15 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
447 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  28.38 
 
 
463 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
498 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
447 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  28.69 
 
 
453 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.69 
 
 
493 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.29 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  27.21 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
478 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>