More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2843 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  100 
 
 		 446 aa  882    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  53.47 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 473 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.48 
 
 		 444 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  52.7 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  51.8 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 472 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1090  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 463 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5181  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.93 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.71 
 
 		 464 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3461  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 460 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.41 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.57 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6640  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5795  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6160  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7710  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 476 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6780  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549939  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 464 aa  199  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3753  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.81 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.89 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 514 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1929  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0480114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 467 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  30.52 
 
 		 467 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.31 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.72 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4559  transcriptional regulator  32.07 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.25 
 
 		 467 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2717  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.61 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.93 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.59 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.31 
 
 		 474 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000631  transcriptional regulator GntR family threonine metabolism  29.12 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1406  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.5 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.36 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.61 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0563  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.43 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 481 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.45 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0678  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 465 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.776198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 465 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0975  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.669245  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.53 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3701  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5878  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  34.61 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2106  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0493633  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  28.83 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 466 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1932  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.48 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.557611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0183  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214272  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3169  hypothetical protein  30.99 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6093  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1984  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1857  putative transcription regulator protein  30.14 
 
 		 463 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532766  normal  0.0261786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.28 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2016  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>