More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0940 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 462 aa  881    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.13 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.54 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.08 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 430 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.57 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  35.84 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 449 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.58 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  36.26 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.63 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.32 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.47 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.07 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 477 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.94 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.57 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.68 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.89 
 
 		 480 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 480 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  25.58 
 
 		 482 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 477 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.56 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.46 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  23.59 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 482 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 477 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 482 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.17 
 
 		 482 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 482 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.12 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.96 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  24.12 
 
 		 477 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.96 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 477 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 444 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02394  putative transcription regulator protein  29.7 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.06 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 502 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.29 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  28.09 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  31.64 
 
 		 457 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 498 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 504 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.28 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 493 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.5 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>