More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2696 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 430 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  99.07 
 
 		 430 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  98.84 
 
 		 430 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  97.67 
 
 		 430 aa  854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  98.6 
 
 		 430 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  51.05 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.42 
 
 		 428 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  43.71 
 
 		 455 aa  316  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  41.34 
 
 		 436 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.7 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.94 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.65 
 
 		 446 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0017  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.49 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.76 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 442 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.61 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.71 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.86 
 
 		 441 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.93 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.71 
 
 		 497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.47 
 
 		 497 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  28.74 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.95 
 
 		 477 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.53 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 495 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.54 
 
 		 477 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2093  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.57 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.619312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.99 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.63 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 488 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 488 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  25.53 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 488 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.41 
 
 		 495 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  31.52 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.76 
 
 		 488 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.57 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 501 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 498 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 488 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 477 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 477 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  27.58 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.04 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 488 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  25.58 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 469 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 501 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  28.47 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.47 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02394  putative transcription regulator protein  26.1 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  28.47 
 
 		 468 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 466 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 480 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 477 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.97 
 
 		 483 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02620  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  29.13 
 
 		 382 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  27.71 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.41 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 547 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>