More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2147 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 453 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  70.22 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  55.08 
 
 		 454 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.53 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.09 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  54.78 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  48.07 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.88 
 
 		 468 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.42 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  42.99 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 547 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  29.19 
 
 		 468 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.03 
 
 		 517 aa  179  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  29.45 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.25 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.92 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 481 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 492 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  25.11 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.32 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  31.24 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.32 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.32 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  30.32 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  30.32 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 514 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 606 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.21 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 503 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.12 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 494 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 494 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.23 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 477 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  29.89 
 
 		 468 aa  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  29.89 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.89 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.82 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  29.89 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.76 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.96 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.1 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 480 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.45 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.29 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.48 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.15 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.8 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  25.94 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.12 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.37 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>