More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8800 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 422 aa  814    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  69.29 
 
 		 454 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.32 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  54.78 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.3 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.23 
 
 		 468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.49 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  41.95 
 
 		 470 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.27 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 547 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.87 
 
 		 517 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  27.74 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  27.34 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 498 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  39.81 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  39.81 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  39.81 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 477 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.62 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.62 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.68 
 
 		 503 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  38.98 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  28.61 
 
 		 344 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.19 
 
 		 482 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.46 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.19 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  26.62 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 477 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.58 
 
 		 477 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.87 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.91 
 
 		 487 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  32.03 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.17 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 477 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.4 
 
 		 483 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.19 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.1 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  31.79 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.93 
 
 		 480 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.93 
 
 		 480 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 480 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 480 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.46 
 
 		 436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  31.04 
 
 		 478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 480 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.53 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  33.56 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  33.44 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.61 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  31.54 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  23.23 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.57 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 496 aa  143  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>