More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0751 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 461 aa  895    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.67 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  49.2 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  50.5 
 
 		 422 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.06 
 
 		 483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  48.07 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.44 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.88 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 470 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  31.18 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.41 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.52 
 
 		 490 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.89 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 479 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 478 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.1 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 473 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.25 
 
 		 471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  27.09 
 
 		 485 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.51 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  28.31 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.4 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.38 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.65 
 
 		 503 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.04 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  28.54 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.73 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 480 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.35 
 
 		 477 aa  156  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 480 aa  156  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.56 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.56 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 547 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  25.05 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.33 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 480 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 569 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.96 
 
 		 477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 477 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 473 aa  153  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 477 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.83 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.91 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  23.69 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  27.61 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 504 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  29.98 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.64 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.99 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  30.21 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>