More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2457 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  81.84 
 
 		 468 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 470 aa  930    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  65.46 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.9 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.34 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  39.53 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 422 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.85 
 
 		 483 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.48 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 498 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.25 
 
 		 517 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  29.04 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 		 554 aa  159  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  24.95 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  24.51 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 547 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  24.56 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  30 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.44 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.08 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.11 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  23.85 
 
 		 477 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  23.82 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.5 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.05 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 501 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.38 
 
 		 477 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.93 
 
 		 464 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  24.18 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0253  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  26.65 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.78 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4791  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.18 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3062  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1890  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 504 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4265  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 485 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  24.69 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  26.4 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0258  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2733  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.87 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 478 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.14 
 
 		 473 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 474 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 480 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2948  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216869  normal  0.403502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.24 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3084  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.189557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  24.93 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0968  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 497 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.842177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  24.84 
 
 		 480 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>