More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3990 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 468 aa  911    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.4 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  58.03 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.51 
 
 		 482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  40.42 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 461 aa  269  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  42.23 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.9 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.25 
 
 		 461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  27.23 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 547 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.65 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 477 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  26.94 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2320  regulatory protein GntR HTH  30.55 
 
 		 464 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303874  normal  0.360666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2596  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.55 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.59 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 473 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.64 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 386 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.41 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 520 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.27 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29.01 
 
 		 406 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  31.84 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  28.95 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.63 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.44 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 477 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  26.78 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.99 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.25 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  24.73 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.02 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_003296  RS02394  putative transcription regulator protein  29.12 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2275  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.69 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  27.44 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 475 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  28.09 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  24.73 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  27.08 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 611 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  24.01 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.01 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2213  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157881  normal  0.27822 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  23.53 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>