More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6695 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 461 aa  959    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 483 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 504 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 473 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  34.19 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.41 
 
 		 480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 478 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.39 
 
 		 478 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  32.97 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.17 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.18 
 
 		 492 aa  269  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 496 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 476 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.78 
 
 		 487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 473 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 472 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 469 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  31.81 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  32.67 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.75 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.1 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  31.81 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.59 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  32.01 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  31.81 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  31.59 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  32.67 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.22 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.83 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 473 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 479 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 473 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 475 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 474 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.66 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 483 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 474 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.61 
 
 		 475 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.97 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.95 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 472 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 472 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  31.66 
 
 		 493 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 477 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 477 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  31.24 
 
 		 471 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  31.24 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.42 
 
 		 477 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.09 
 
 		 479 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 474 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 474 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 478 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 475 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 473 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 475 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.05 
 
 		 473 aa  249  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>