More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2010 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 483 aa  917    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.63 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  56.33 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  54.18 
 
 		 453 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  54.56 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  47.9 
 
 		 461 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  44.09 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.06 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.19 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.71 
 
 		 517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 487 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.32 
 
 		 468 aa  177  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.31 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 477 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 477 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  25.71 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 554 aa  170  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  25.35 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  32.46 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.09 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.67 
 
 		 503 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 476 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.85 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.85 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.18 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.54 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  25.63 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 480 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 480 aa  156  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 480 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.58 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.41 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.65 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  28.6 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.65 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  28.02 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.02 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.65 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  28.02 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  27.83 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  27.17 
 
 		 471 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  29.14 
 
 		 344 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  31.25 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.82 
 
 		 398 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 470 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  28.7 
 
 		 474 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  29 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  28.7 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.08 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.53 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  29.42 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>