95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1567 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  84.34 
 
 		 249 aa  458  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  81.93 
 
 		 249 aa  448  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  85.14 
 
 		 249 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  47.77 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  39.52 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  38.21 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  39.84 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  33.6 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  35.18 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  31.05 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  30.8 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  32.35 
 
 		 396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  31.47 
 
 		 270 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  31.98 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  30.36 
 
 		 378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  32.56 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  28.92 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  33.15 
 
 		 351 aa  97.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  29 
 
 		 360 aa  90.5  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  28 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  26.88 
 
 		 349 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  25.58 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  25.64 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  28.77 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  26.92 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  31.32 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  31.32 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  33.56 
 
 		 917 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  33.56 
 
 		 917 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  31.69 
 
 		 848 aa  51.6  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  31.21 
 
 		 1045 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  32.64 
 
 		 848 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  31.94 
 
 		 871 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 861 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  32.62 
 
 		 924 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  31.94 
 
 		 868 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 835 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  34.03 
 
 		 838 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  34.03 
 
 		 836 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  34.03 
 
 		 836 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  31.25 
 
 		 824 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  31.43 
 
 		 887 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 832 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 921 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 700 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 989 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 856 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 989 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  32.12 
 
 		 990 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  32.39 
 
 		 885 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  31.88 
 
 		 875 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 975 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 981 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10835  predicted protein  29.08 
 
 		 579 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  32.39 
 
 		 926 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 971 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 964 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  32.12 
 
 		 959 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62149  predicted protein  29.85 
 
 		 625 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  31.94 
 
 		 1083 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  26.69 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 883 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  30.66 
 
 		 873 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  30.82 
 
 		 856 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  26.95 
 
 		 1008 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 		 880 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 880 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 		 880 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  27.66 
 
 		 990 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 		 880 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 		 880 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  30.17 
 
 		 690 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 886 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  32.09 
 
 		 880 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 912 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  30.17 
 
 		 693 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  29.71 
 
 		 911 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  31.16 
 
 		 917 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  30.94 
 
 		 886 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  29.45 
 
 		 883 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  31.21 
 
 		 1131 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0956  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 683 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 		 1058 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  30.28 
 
 		 883 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  27.71 
 
 		 915 aa  42.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  29.37 
 
 		 936 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  32.84 
 
 		 894 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  35.24 
 
 		 954 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  32.85 
 
 		 890 aa  42  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  27.03 
 
 		 598 aa  42  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  31.34 
 
 		 845 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  32.12 
 
 		 854 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 845 aa  42  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  30.66 
 
 		 831 aa  42  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>