31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1948 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  37.8 
 
 
270 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  39.08 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  34.16 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  30.74 
 
 
255 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  31.69 
 
 
248 aa  122  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  29.63 
 
 
252 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  30.4 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  31.98 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  32.5 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  33.46 
 
 
249 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  28.92 
 
 
249 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  26.78 
 
 
405 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  35.96 
 
 
221 aa  99  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  27.62 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  25.93 
 
 
378 aa  92.4  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  28.42 
 
 
396 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  31.67 
 
 
360 aa  86.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  27.14 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  29.35 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  27.52 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  30.65 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  28.05 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  29.89 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  30.06 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  29.14 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  32.61 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  32.61 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  29.66 
 
 
478 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  27.48 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.37 
 
 
407 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>