28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61200 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  100 
 
 
378 aa  781    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  60.25 
 
 
396 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  57.01 
 
 
405 aa  384  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  46.83 
 
 
353 aa  292  7e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  45.93 
 
 
248 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  33.47 
 
 
262 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  32.1 
 
 
252 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  29.89 
 
 
255 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  32.98 
 
 
249 aa  110  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  29.96 
 
 
250 aa  109  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  34.68 
 
 
249 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  28.05 
 
 
270 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  28.71 
 
 
255 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  34.1 
 
 
249 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  29.25 
 
 
254 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  29.17 
 
 
274 aa  96.3  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  32.77 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  27.98 
 
 
248 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  30.51 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  25.93 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  30.51 
 
 
276 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  27.78 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  29.94 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  23.1 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  23 
 
 
256 aa  63.5  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  20.92 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  27.42 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  26.88 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>