28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04680 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  55.85 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  44.85 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  45.42 
 
 
221 aa  219  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  41.64 
 
 
270 aa  186  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  41.26 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  38.22 
 
 
360 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  34.24 
 
 
256 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  35.63 
 
 
349 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  33.71 
 
 
351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  32.09 
 
 
306 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  33.14 
 
 
255 aa  102  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  24.71 
 
 
262 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  31.46 
 
 
254 aa  99  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  28.92 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  29.7 
 
 
249 aa  96.3  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  28.71 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  28.32 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  33.58 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  29.38 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  24.71 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  28.8 
 
 
396 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  28.25 
 
 
405 aa  89.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  26.85 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  29.94 
 
 
378 aa  82.4  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  25.52 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  29.14 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  25.24 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>