28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0585 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  37.8 
 
 
260 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  34.5 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  33.6 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  33.06 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  33.07 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  34.12 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  30.86 
 
 
255 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  30.08 
 
 
252 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  31.47 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  31.45 
 
 
248 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  29.15 
 
 
353 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  29.08 
 
 
405 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  31.47 
 
 
249 aa  102  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  28.05 
 
 
378 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  27.53 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  25.8 
 
 
396 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  31.84 
 
 
360 aa  84  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  25.52 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  27.24 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  35.16 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  36.36 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  29.67 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  24.23 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  30.05 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  27 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  30.47 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  30.47 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>