31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0371 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  39.52 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  37.5 
 
 
249 aa  183  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  38 
 
 
249 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  38.15 
 
 
255 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  34.13 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  36.69 
 
 
249 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  37.75 
 
 
254 aa  165  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  38.43 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  33.47 
 
 
252 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  34.88 
 
 
270 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  32.55 
 
 
405 aa  139  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  33.47 
 
 
378 aa  132  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  35.81 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  33.33 
 
 
396 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  30 
 
 
260 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  31.72 
 
 
353 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  35.96 
 
 
360 aa  108  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  25 
 
 
287 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  30.05 
 
 
221 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  29.41 
 
 
274 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  29.27 
 
 
351 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  27.95 
 
 
276 aa  99.4  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  28.32 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  25.93 
 
 
256 aa  89  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  27.41 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  30.42 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  30.42 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  25 
 
 
591 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  25.77 
 
 
600 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  24.24 
 
 
602 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>