28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12963 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  99.26 
 
 
270 aa  551  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  43.87 
 
 
276 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  41.15 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  41.95 
 
 
287 aa  219  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  45.65 
 
 
221 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  37.8 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  36.82 
 
 
351 aa  161  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  32.99 
 
 
306 aa  158  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  35.74 
 
 
349 aa  155  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  32.71 
 
 
360 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  29.69 
 
 
255 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  30.42 
 
 
262 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  30.66 
 
 
254 aa  105  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  34.09 
 
 
252 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  30.15 
 
 
255 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  30.94 
 
 
405 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  32.61 
 
 
260 aa  89  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  33.33 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  28.8 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  31.32 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  27.18 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  30 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  32.09 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  27.42 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  26.84 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  25.54 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  25.7 
 
 
353 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>