37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68965 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  100 
 
 
274 aa  559  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  55.85 
 
 
287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  47.27 
 
 
221 aa  246  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  44.49 
 
 
276 aa  230  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  41.63 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  41.63 
 
 
270 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  38.37 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  32.93 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  34.77 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  35.32 
 
 
351 aa  157  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  31.86 
 
 
306 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  32.5 
 
 
396 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  31.95 
 
 
252 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  33.71 
 
 
255 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  28.74 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  29.17 
 
 
378 aa  96.7  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  30.16 
 
 
405 aa  95.9  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  28.8 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  30.43 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  28 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  28.04 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  31.87 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  30.65 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  28.57 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  28.33 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  29.89 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  25.22 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  36.36 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  26.02 
 
 
288 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1189  arsenite-activated ATPase ArsA  27.03 
 
 
578 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  27.34 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  30.38 
 
 
288 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.36 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>