57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1730 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  87.15 
 
 		 249 aa  462  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  85.14 
 
 		 250 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  85.14 
 
 		 249 aa  449  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  49.59 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  38.87 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  39.18 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  36 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  37.5 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  36.55 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  29.63 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  31.05 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  29.71 
 
 		 353 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  33.46 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  32.23 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  31.47 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  34.68 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  35.36 
 
 		 351 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  29.21 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  32.76 
 
 		 360 aa  97.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  28.84 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  29.23 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  27.05 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  27.65 
 
 		 349 aa  86.3  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  27.03 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  28.37 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  31.15 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  31.15 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 868 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 848 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  27.52 
 
 		 917 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  27.52 
 
 		 917 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 921 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 871 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 838 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  26.85 
 
 		 848 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  26.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  27.49 
 
 		 989 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 836 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 836 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  27.49 
 
 		 989 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  27.89 
 
 		 887 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  26.5 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  26.39 
 
 		 835 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  27.78 
 
 		 971 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 883 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 873 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  27.78 
 
 		 861 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 924 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 886 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  27.08 
 
 		 981 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  29.25 
 
 		 975 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  29.25 
 
 		 880 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  26.39 
 
 		 824 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  25.69 
 
 		 832 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  26.39 
 
 		 1008 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  40.58 
 
 		 323 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>