61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1747 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1747  GTPase  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  84.74 
 
 		 249 aa  457  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  84.34 
 
 		 250 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  87.15 
 
 		 249 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  47.52 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  37.5 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  37.8 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  38.62 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  33.2 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  35.97 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  33.61 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  33.06 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  34.81 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  28.68 
 
 		 353 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  36.47 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  34.68 
 
 		 378 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  28.92 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  35.91 
 
 		 351 aa  98.6  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.85819 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  33.91 
 
 		 360 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  28.71 
 
 		 287 aa  95.1  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  28.8 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  26.74 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  26.15 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  27.34 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  25 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  25.96 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  29.03 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  29.03 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 917 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  29.58 
 
 		 917 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  28.97 
 
 		 848 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  32.85 
 
 		 861 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  30.66 
 
 		 848 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  30.5 
 
 		 924 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 871 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  29.86 
 
 		 868 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 836 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 838 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 836 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  29.29 
 
 		 887 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  29.82 
 
 		 989 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  29.82 
 
 		 989 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  26.39 
 
 		 835 aa  45.4  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 971 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 981 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  29.08 
 
 		 990 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  25.53 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  26.39 
 
 		 824 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 975 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  28.17 
 
 		 885 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  29.1 
 
 		 845 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  30.28 
 
 		 926 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 845 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  26.95 
 
 		 1045 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 990 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  29.79 
 
 		 908 aa  42.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  29.66 
 
 		 1083 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  28.47 
 
 		 921 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  29.71 
 
 		 875 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  25.69 
 
 		 832 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  30.66 
 
 		 880 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>