28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0042 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  100 
 
 		 252 aa  500  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  40.8 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  41.83 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  37.3 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  36.4 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  35.97 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  36.36 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  33.73 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  36.55 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  35.18 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  34.58 
 
 		 405 aa  131  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  32.1 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  34.47 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  29.63 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  31.37 
 
 		 396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  32.39 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  30.08 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  31.34 
 
 		 353 aa  111  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  33.71 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.85819 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  33.14 
 
 		 349 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  31.98 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  31.95 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  28.32 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  31.63 
 
 		 306 aa  92.8  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  28.9 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  27.23 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  34.09 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  34.09 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>